Научной деятельности Института соответствует его структура, которая в 2018 представлена следующими научными подразделениями:
- отдел токсикологии;
- отдел фармакологии клеточных сигнальных систем и экспериментальной терапии;
- отдел фармакологии:
- лаборатория фармакологии противомикробных средств;
- лаборатория фармакологии эффекторных органов и систем;
- лаборатория онкофармакологии; - Государственная лаборатория по контролю качества лекарственных средств;
- отдел медицинской химии;
- отдел научно-методической, информационной и патентно-лицензионной работы.
В настоящее время коллектив Института составляет 138 сотрудников; количество научных сотрудников - 80; общее количество докторов наук - 15; кандидатов наук - 23; среди которых 2 члена-корреспондента НАМН Украины, 7 профессоров, 3 имеют почетное звание Заслуженный деятель науки и техники Украины, 2 - лауреаты Государственной премии Украины (один из них дважды лауреатом).